Das Cartoonmuseum Basel verfolgt das Ziel, seine qualitativ hochstehende Ausstellungs- und Vermittlungstätigkeit kontinuierlich weiterzuentwickeln und zugleich seine herausragende Sammlung sowie die hauseigene Bibliothek nachhaltig auszubauen. Damit stärkt es seine Position als führendes Museum für narrative Kunst in der Schweiz und als europaweit renommiertes Haus für erzählende Bildkunst.

Als private Institution erhält das Cartoonmuseum Basel keine Subventionen der öffentlichen Hand. Es ist ein Betrieb der Christoph Merian Stiftung, die das Museum mit einem Betriebsbudget trägt und in verschiedenen Bereichen des Backoffice unterstützt. Mehr als ein Drittel seiner Ausgaben erwirtschaftet das Museum selbst durch Einnahmen aus dem Museumsbetrieb – etwa durch Eintritte, Führungen und den Museumsshop –sowie zu laufend akquirierenden Ausstellungsbeiträgen.

Um seine hohe Qualität, seine internationale Ausstrahlung und seine inhaltliche Weiterentwicklung langfristig zu sichern, ist das Cartoonmuseum Basel auf die Unterstützung des Freundeskreises «Cartoon Circle» sowie auf Partnerschaften mit Institutionen und Unternehmen angewiesen, die sich der narrativen Kunst verbunden fühlen. Mitglieder des Freundeskreises profitieren von freiem Eintritt und weiteren Vergünstigungen. Sponsor:innen profitieren vom Interesse eines breiten Publikums an einer populären Kunstform sowie von der internationalen Ausstrahlung eines schweizweit einzigartigen, sehr gut besuchten Hauses. Sie tragen dazu bei, die Zukunft einer kulturellen Institution zu sichern, die weit über die Landesgrenzen hinaus Anerkennung geniesst.